من ناحية التشريح النباتي، الفاكهة هي عبارة عن مبيض أزهار ناضج ويحتوي على بذور، وذلك ينطبق على كل من الطماطم والخوخ والكوسا والبطيخ، لذلك تعتبر الطماطم فاكهة صالحة للأكل. لكن يظل سؤال "الفاكهة أو الخضار" صالحًا أيضًا لأي خضروات تحتوي على بذور.
مع وضع هذا التعريف في الاعتبار، تُصنف الطماطم بأنها فاكهة لأنها تحتوي على بذور وتنمو من زهرة نبات الطماطم، وفقا لموقع "يوفيك" (EUFIC). بالمقابل فإذا أردنا تعريفها وفقا للطهي، فإن "الخضار" عادة ما يكون قوامها أكثر صلابة، ومذاقها ألطف وغالبًا ما تتطلب الطهي في أطباق مثل اليخنة أو الحساء أو البطاطس المقلية.
جذوع النبات ضعيفة ولذا يزحف النبات على الأرض إن لم يُعرَّش. النبات معمر في بيئاته الطبيعية الأصلية، على الرغم من أنها تزرع في كثير من الأحيان في الهواء الطلق وفي المناخات المعتدلة سنويًا. ووفقًا لموقع sciencebob، فإن وضع الطماطم ضمن فئة الخضروات، في المحلات التجارية وكتب الطبخ، أمر غير صحيح، يشترك فيه معظم دول العالم
